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白人与亚裔新冠病毒受体表达无差异,吸烟者或更易感 精选

已有 9177 次阅读 2020-2-17 15:25 |个人分类:小柯生命|系统分类:论文交流

美国南卡罗莱纳大学助理教授蔡国帅通过分析大规模数据集发现,在种族(亚裔与白种人)、年龄(大于60岁与小于60岁)或性别(男性与女性)之间,新冠病毒受体ACE2基因的表达没有显著差异。而在吸烟者中,ACE2基因的表达均有升高。


在过去的二十年中,致病性冠状病毒(CoV)引起了流行性感染,包括2003年的重症急性呼吸综合征(SARS)、2012年的中东呼吸综合症(MERS)和最近的新冠病毒(2019-nCoV)。
 
根据SARS-Cov和MERS-Cov的研究表明,不同的人群对这些病毒存在着不同的敏感性。比如,流行病学的研究发现男性比女性具有更高的发病率和死亡率。因此,不同人群对2019-nCov的敏感性也可能是存在差异的。
 
当前紧急的是需要发现2019-nCov对哪些人群具有更高的感染性和疾病严重性,这能够为特定人群提供有效的预防和护理。最近,研究表明2019-nCov和SARS-nCov利用同样的受体ACE2进入细胞。
 
美国南卡罗莱纳大学助理教授蔡国帅分析了四个正常肺组织的大规模数据集,以调查与种族、年龄、性别和吸烟状况有关的ACE2基因表达差异。相关论文发表在预印本网站medRxiv上。
 
注意:预印本网站medRxiv的所有论文未经同行评议。


作者分析了来自肺癌患者的两个RNA-seq数据集和两个DNA微阵列数据集,具体为:来自TCGA的白种人RNA-seq数据集(https://www.cancer.gov/tcga)、来自GEO的亚洲人RNA-seq数据集(GSE404196)、来自GEO的亚洲微阵列数据集(GSE198047)以及来自GEO的白种人微阵列数据集(GSE100728)。两种RNA-seq数据集均使用Illumina HiSeq平台产生,两个微阵列数据集均使用Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Array产生。
 
所有数据集均包含成对的肿瘤和正常样本,研究人员仅使用了正常样本数据。他们总共分析了TCGA数据集中的54个样本、GSE40419数据集中的77个样本、GSE19804数据集中的60个样本以及GSE10072数据集中的33个样本。
 
主要发现:
 
●在种族(亚裔与白种人)、年龄(大于60岁与小于60岁)或性别(男性与女性)之间,ACE2基因的表达没有显著差异。
 
●但是,在包含吸烟史的三个数据集中(GSE10072、GSE40419(即下图中的korea)、TCGA),ACE2基因的表达在吸烟者中均有升高。
 
●在调整其他因素(年龄、性别、种族和数据集)后的多因素分析中,吸烟者仍表现出显著的ACE2升高(p=0.008)。
 
222.png

总之,这一分析表明吸烟者可能更容易感染2019-nCov,因此在确定易感人群和标准化治疗方案时应考虑吸烟史。
 
此外需要注意的是,这项研究也具有一定局限性。
 

  • 这项研究所分析的数据来自肺腺癌患者的正常肺组织,这可能与健康人的肺组织有所不同。

  • 这些分析基于大块组织的平均表达,这不利于评估特定细胞的ACE2表达水平(例如AT2细胞能够特异性表达高水平的ACE2)。

  • ACE2是否为2019-nCov的唯一受体尚不清楚。

  • 吸烟为何与ACE2表达升高相关尚不清楚。

 
作者:Guoshuai Cai
论文相关信息:Tobacco-use disparity in geneexpression of ACE2, the receptor of 2019-nCov
DOI: 10.1101/2020.02.05.20020107




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